Os ganhador de cada chave passam para a segunda fase, onde estréiam os primeiros classificados dos países anteriores e todos os participantes do Brasil e da Argentina.

Segunda fase

Chave 01
07/09 – 22:45 – Ganhador Chave D x San José
22/09 – 20:45 – San José x Ganhador Chave D

Chave 02
26/08 – 21:15 – Independiente x Argentinos Juniors
07/09 – 19:30 – Argentinos Juniors x Independiente

Chave 03
02/09 – 22:45 – Ganhador Chave C x Peñarol
14/09 – 19:15 – Peñarol x Ganhador Chave C

Chave 04
11/08 – 21:50 – Vitória x Palmeiras
19/08 – 21:50 – Palmeiras x Vitória

Chave 05
08/09 – 23:00 – Ganhador Chave H x Caracas
23/09 – 22:45 – Caracas x Ganhador Chave H

Chave 06
12/08 – 21:50 – Santos x Avaí
18/08 – 21:50 – Avaí x Santos

Chave 07
14/09 – 21:45 – Ganhador Chave E x Deportes Tolima
21/09 – 22:15 – Deportes Tolima x Ganhador Chave E

Chave 08
LDU – a Liga de Quito ocupa o lugar da Chave 08 e entra direto
nas oitavas-de-final por ser a atual campeã da Copa Sul-americana

Chave 09
15/09 – 20:15 – Ganhador Chave B x Unión San Felipe
23/09 – 20:15 – Unión San Felipe x Ganhador Chave B

Chave 10
02/09 – 20:15 – Vélez x Banfield
16/09 – 19:00 – Banfield x Vélez

Chave 11
09/09 – 22:30 – Ganhador Chave G x Emelec
15/09 – 22:30 – Emelec x Ganhador Chave G

Chave 12
04/08 – 19:00 – Grêmio Prudente x Atlético-MG
11/08 – 21:50 – Atlético-MG x Grêmio Prudente

Chave 13
09/09 – 20:15 – Ganhador Chave A x Cerro Porteño
21/09 – 20:15 – Cerro Porteño x Ganhador Chave A

Chave 14
05/08 – 19:30 – Goiás x Grêmio
12/08 – 19:30 – Grêmio x Goiás

Chave 15
16/09 – 21:45 – Ganhador Chave F x Sport Huancayo
22/09 – 23:15 – Sport Huancayo x Ganhador Chave F

Chave 16
19/08 – 22:30 – Newell’s x Estudiantes
22/09 – 20:45 – Estudiantes x Newell’s